早产儿所面临的问题主要是体型过小以及器官发育不完全。
早产肺部疾病，也称作呼吸窘迫综合征，主要是因为肺部缺乏表面活性物质（是小气囊张开所必需的化合物）（见第四部分：胎儿发育，肺）。有些早产儿可能需要气管插管来人为提供这种化合物。他们可能还会需要呼吸机来辅助呼吸，直到他们自己的力量增强，肺功能变得更加完善。
早产儿在维持体温上也会有困难（体温过低），因此需要把他们包裹在电热毯里面。此外，他们还不能很好地调节体内的糖、钙和镁水平，因此需要静脉注射来提供这些物质。静脉注射通常是通过脐带血管来完成的（脐动脉导管或脐静脉导管）。
早产儿在吮吸、吞咽和消化上也有障碍，因此可能首先需要静脉注射来喂养，而后逐渐使用导管从鼻子或嘴插入到胃里（喂饲管）来进行喂养。给早产儿喂食过早，可能会造成坏死性小肠结肠炎，当然这也可能是自发的。坏死性小肠结肠炎是指肠道因内壁细胞坏死而不能消化食物，而细胞坏死又是因为对相应区域供血供氧不足所造成的。在晟坏的情况下，坏死性小肠结肠炎可能是致命的。
早产儿通常会患黄疸，即使只提前出生几周也一样，这是由于他们肝脏发育还不成熟。不过皮肤上的黄色会随着时间而消失的。可以通过紫外光照射进行治疗，这是因为紫外光可以促进这些因红细胞降解而堆积的胆红素代谢掉。
