男性生殖器官分内生殖器和外生殖器两部分。内生殖器包括睾丸、附睾、输精管、射精管和附属腺。外生殖器包括阴茎、阴囊和阴阜。
男性外阴部有一器官叫阴茎，阴茎的头部叫龟头，龟头周围的一层皮肤就叫做包皮。阴茎根部的下面就是阴囊，阴囊里有一对睾丸，睾丸在性成熟后能产生精子，精子很小，肉眼看不见，形状像蝌蚪。
睾丸的后上方有一些弯曲的小管叫做附睾，是精子的主要贮存地，附睾一端连接睾丸，另一端连接着输精管，输精管是输送精子的管道，此管道很长。在通往腹腔的一端旁有一像小口袋样的器官就叫精囊，精囊属生殖器的附属腺，能够产生出多量的白色黏液。精子从睾丸产生后，到达精囊附近时，就和白色黏液混合在一起排出体外，这就是精液。精囊的开口和输精管会合后，就合成一根管子叫做射精管，射精管向前穿过一个小囊，这个小囊就叫前列腺。前列腺形如栗子，位于膀胱下方，能分泌黏液，还能产生前列腺素。前列腺除了左右两条射精管通过以外，尿道也从里面穿过，它是精液和尿液共同经过的地方。
由此可见，精液从生殖器排出的通道是：睾丸→附睾→输精管→射精管→尿道口。
儿童的生殖器官10岁以前发育甚微，到青春期才突然迅速发育，内部结构也彻底改变，从此才进入有功能的时期，出现第二性征和产生精子。男性在发育过程中睾丸是起主导作用的，阉割了的儿童，其附属腺和阴茎等以后就得不到正常发育，所以生殖器的发育不同于身高和体重，而是有其本身的独特性。
男孩在出生时，睾丸已下降到阴囊，如果不下降或不完全下降就叫做隐睾。隐睾有单侧和双侧两种，但大部分隐睾能在1岁以内自行下降，如果2岁以后仍不下降者则需手术治疗。有的隐睾患儿还合并有疝气或尿道下裂等，这些都需要及早手术，否则成年后会丧失生育能力。
男孩中包茎和包皮过长较常见。阴茎皮肤覆盖阴茎头称包皮。小儿的包皮完全包着阴茎头，到成年时只包少许或不包，如仍完全包着阴茎头者叫包皮过长；如同时不能翻转到阴茎头后方就叫包茎，两者都能发J生包皮阴茎头炎症，还可继发尿道口狭窄，发生排尿困难。如时间过久就产生包皮垢，包皮垢不断刺激包皮，引起局部发炎、红肿、疼痛，长期刺激还会诱发阴茎癌。所以儿童有包茎时应及时手术治疗：有包皮过长者要经常常用温开水或1/5000高锰酸钾溶液洗局部，能长期保持清洁卫生即可，不一定非动手术不可。
鞘膜积液也是男孩易发的常见病。根据积液所在部位不同又分为精索鞘膜积液、睾丸鞘膜积液和交通性（精索、睾丸同时出现）鞘膜积液。
这种病症的临床表现为：积液的局部出现肿胀、光滑，有透光现象，不能摸到睾丸或精索。儿童到了学龄时期还有鞘膜积液者已经没有自愈可能，所以发现后应早期确诊早期手术治疗，但此病应与疝气相鉴别。
