消化系统包括消化管和消化腺两部分。
消化管包括口腔、咽、食管、胃、小肠、大肠和肛门；消化腺包括唾液腺、胃腺、肠腺、胰腺和肝脏。消化腺具有分泌各种消化液的功能，消化液内含有能使食物消化分解的物质叫消化酶，如唾液中的淀粉酶、胃内的胃蛋白酶、胰腺产生的胰淀粉酶等。
消化管主要是由黏膜和平滑肌构成的。随着消化管壁平滑肌的收缩和放松，引起消化管的蠕动，将混有消化液的食物向前推进，通过消化器官进行消化和吸收，最后的食物残渣形成大便，由肛门排出。
儿童消化管与成人的区别是：儿童消化管的黏膜非常细嫩，血管较多，消化功能较差，因而要特别注意饮食卫生，防止消化不良和发生胃肠道疾病。
此外应注意的是，吃过辣过烫的食物容易烫伤食管壁；吃坚硬的食物如鱼刺、碎骨片等易刺破食管黏膜引起炎症；边吃边谈笑则容易把米粒、黄豆、花生仁等呛入喉腔或气管引起剧烈咳嗽，严重者甚至造成窒息、死亡。
消化系统运行得正常与否，与牙齿有着很大的关系。牙齿不好就会增加胃肠负担。儿童时期要经历一次换牙的生理过程。一般6~7岁时，乳齿便开始脱落（乳齿有20个），随之慢慢长出恒牙来，12~13岁时全部交换完成。换牙期间，可出现暂时性的牙列不齐，很易嵌塞食物，刺伤牙龈而发炎。有的儿童习惯于张口呼吸使牙龈干燥，发生增殖性牙龈乳头肥大，引起咀嚼疼痛。龋齿是儿童最常见的口腔牙病，一般4~8岁是乳龋高发期，11~18岁少年则恒龋多见。
儿童从小应讲究口腔卫生，要养成饭后漱口、早晚刷牙的卫生习惯，不吃过冷的食物，不喝过冷的水。要多吃些需要多咀嚼的食物如水果、烤馒头片等，以利牙齿的正常发育。食物中应少含糖，多含磷、钙、维生素D等。
相对而言，儿童的肠管比成人的要长些，肠道蠕动也比成人弱，腹肌的推动力更是不足，这些原因造成食物通过比较慢，很容易引起消化不良、便秘、厌食等症状。
要合理安排进餐时间和营养素的分配，要养成按时进餐的习惯，不偏食、不吃零食、不暴饮暴食。此外，因营养不良而患便秘的儿童要多饮水，多吃粗粮和含膳食纤维多的蔬菜（如芹菜、丝瓜等）。消化管和消化腺的活动都是在神经调节下进行的，因此进食时保持儿童的精神愉快，对促进消化吸收具有非常重要的作用。
