在绝大多数传染病（如麻疹、白喉、脊髓灰质炎等）已被基本控制的今天，为什么菌痢则依然如故，发病率至今下降不多，有时还会暴发流行呢？
其原因为：
①痢疾杆菌的种类多、变异性大：菌痢是由痢疾杆菌引起的，最常见的种类有：福氏、宋内、志贺、舒密次、鲍依德杆菌，而以上每种杆菌又可分为许多型及亚型，譬如：福氏（B群）可分为1～6型及X。Y变种等多种亚型。每一个型的痢疾杆菌是一种抗原，它们相互之间没有交叉免疫力。所以，这次得了一种，下次可以得另一种细菌引起的痢疾。再加上菌型容易变异，则进一步加深了痢疾杆菌分型的复杂程度，这也是至今为什么制s造不出菌痢疫苗的主要原因。有些反复患菌痢的病人可能是变异菌型的再感染。
②容易感染：菌痢是通过粪便经口传播的，它的传染性强。菌痢病人的1克粪便中，可含1亿多个痢疾杆菌。它对环境的污染非常广泛，如菌痢病人接触过的食具、家具、衣被、书籍、门把手、水龙头等，均可检出痢疾杆菌。苍蝇是常见的传播媒介，易于污染多种用具及食品。痢疾杆菌在水中可生存5～9日，食物中可生存数十日，在低温及潮湿地方可生存几个月。所以在饮食卫生制度不健全的集体单位、托幼机构极易引起菌痢流行。
③治疗不彻底：大多数治疗不彻底的病人均是不遵照医师的医嘱办事，抗生素用的时间太短，见孩子腹泻略有好转则自行停药。正规的抗生素治疗应连续用药5～7日，直至症状完全消失，停药5日后再作大便培养连续3次呈阴性，才是真正的完全治愈。不然的话，极易引起菌痢反复或迁延不愈。
